2017年6月，科睿唯安（原汤森路透知识产权与科技事业部）公布了2016版《期刊引证报告》，昆明植物研究所主办的《真菌多样性》（英文）最新影响因子为13.465，与2015年度的6.991相比，实现了历史新高。
据了解，2011 年 3 月，中科院昆明植物研究所与泰国菌类研究基金会主任、《真菌多样性》（英文）期刊创刊人K. D. Hyde 教授签署合作协议，从此《真菌多样性》成为该所正式官方期刊。7年来，稳步推进，使得该期刊影响因子逐年上升，在全球真菌学领域期刊中排名第二，在中国相关学术机构主办的全部188种SCI期刊中排名第三。
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